Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB6Q9BUF5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms