Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC1Q9BTT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC1Q9BTT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC1Q9BTT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC1Q9BTT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC1Q9BTT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC1Q9BTT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC1Q9BTT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms