Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF559Q9BR84 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms