Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC77Q9BR77 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms