Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms