Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLX1AQ9BQ83 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms