Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms