Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRRX2Q99811 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms