Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMKLR1Q99788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMKLR1Q99788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMKLR1Q99788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms