Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A3Q99624 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms