Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMS19Q96T76 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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