Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM209Q96SK2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms