Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIB3Q96Q77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIB3Q96Q77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms