Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK15Q96Q40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms