Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPG4P5Q96PW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPG4P5Q96PW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPG4P5Q96PW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSPG4P5Q96PW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSPG4P5Q96PW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms