Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU8

QKI, Protein quaking, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKIQ96PU8 SHANK2-206ENST00000424924 6821 ntTSL 510.5□□□□□ -0.738e-32■■■■■ 48.3
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QKIQ96PU8 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 SKA1-205ENST00000494518 746 ntTSL 212.33□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 SKA1-201ENST00000285116 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 SKA1-204ENST00000488454 669 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-218ENST00000498360 951 ntTSL 314.07□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.564e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.994e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.034e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-216ENST00000486657 700 ntTSL 32.37□□□□□ -2.034e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 DNAH14-209ENST00000433124 589 ntTSL 31.76□□□□□ -2.134e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.183e-8■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-206ENST00000506282 658 ntTSL 512.89□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-216ENST00000515497 653 ntTSL 312.89□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.424e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-208ENST00000508421 1586 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.164e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.424e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-217ENST00000515873 279 ntTSL 54.33□□□□□ -1.724e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-205ENST00000505960 834 ntTSL 53.63□□□□□ -1.834e-9■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 CENPK-212ENST00000510768 725 ntTSL 51.48□□□□□ -2.174e-9■■■■■ 48.3
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QKIQ96PU8 KIAA1324L-204ENST00000423294 2911 ntTSL 515.73■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 48.3
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QKIQ96PU8 RAD51AP1-203ENST00000398012 1036 ntTSL 25.01□□□□□ -1.615e-19■■■■■ 48.3
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QKIQ96PU8 RAD51AP1-204ENST00000442992 2235 ntTSL 54.01□□□□□ -1.775e-19■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.895e-19■■■■■ 48.3
QKIQ96PU8 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.22e-12■■■■■ 48.2
QKIQ96PU8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-12■■■■■ 48.2
QKIQ96PU8 SLC25A26-205ENST00000483224 1840 ntTSL 512.01□□□□□ -0.492e-12■■■■■ 48.2
QKIQ96PU8 SLC25A26-203ENST00000413054 1096 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.922e-12■■■■■ 48.2
QKIQ96PU8 SLC25A26-204ENST00000464350 3879 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.042e-12■■■■■ 48.2
QKIQ96PU8 SLC25A26-206ENST00000484768 375 ntTSL 38.14□□□□□ -1.112e-12■■■■■ 48.2
QKIQ96PU8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-10■■■■■ 48.2
QKIQ96PU8 RUNX1-215ENST00000479325 537 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.314e-13■■■■■ 48.1
QKIQ96PU8 ERBIN-206ENST00000503913 544 ntTSL 35.94□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 48.1
QKIQ96PU8 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 416.91■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 48.1
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QKIQ96PU8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 48
QKIQ96PU8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 48
QKIQ96PU8 CAMKMT-206ENST00000428993 526 ntTSL 36.65□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 48
QKIQ96PU8 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 33.87□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 48
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QKIQ96PU8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.611e-11■■■■■ 48
QKIQ96PU8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-11■■■■■ 48
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QKIQ96PU8 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.173e-14■■■■■ 47.9
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QKIQ96PU8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.184e-9■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 TPM1-217ENST00000559108 437 ntTSL 211.07□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 TPM1-227ENST00000560970 1039 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 TPM1-231ENST00000561395 673 ntTSL 57.75□□□□□ -1.174e-9■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 TPM1-222ENST00000560131 537 ntTSL 25.13□□□□□ -1.594e-9■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 47.8
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QKIQ96PU8 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 47.8
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