Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms