Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms