Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM227BQ96M60 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM227BQ96M60 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms