Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4orf36Q96KX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf36Q96KX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf36Q96KX1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms