Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAX2Q96IS3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms