Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BORCS6Q96GS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms