Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC97Q96F63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC97Q96F63 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms