Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
L3HYPDHQ96EM0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L3HYPDHQ96EM0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms