Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms