Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC39Q96DD0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC39Q96DD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms