Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms