Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPCDCQ96CD2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPCDCQ96CD2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms