Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSUN4Q96CB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms