Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms