Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB7BQ96AH8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB7BQ96AH8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB7BQ96AH8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB7BQ96AH8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms