Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1E2Q96A05 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP6V1E2Q96A05 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms