Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP7Q93009 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP7Q93009 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP7Q93009 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP7Q93009 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP7Q93009 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP7Q93009 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP7Q93009 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP7Q93009 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP7Q93009 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP7Q93009 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP7Q93009 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP7Q93009 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP7Q93009 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP7Q93009 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP7Q93009 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP7Q93009 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP7Q93009 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP7Q93009 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP7Q93009 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP7Q93009 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP7Q93009 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP7Q93009 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP7Q93009 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP7Q93009 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP7Q93009 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP7Q93009 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP7Q93009 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP7Q93009 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP7Q93009 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP7Q93009 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP7Q93009 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP7Q93009 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP7Q93009 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP7Q93009 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms