Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDS1Q92903 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDS1Q92903 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDS1Q92903 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDS1Q92903 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS1Q92903 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDS1Q92903 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDS1Q92903 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDS1Q92903 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDS1Q92903 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDS1Q92903 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDS1Q92903 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDS1Q92903 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDS1Q92903 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS1Q92903 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms