Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELL1Q92832 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELL1Q92832 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms