Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGP1Q92546 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RGP1Q92546 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGP1Q92546 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms