Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX19Q92543 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms