Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYDC1Q8WXC3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PYDC1Q8WXC3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PYDC1Q8WXC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms