Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBLCP1Q8WVY7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBLCP1Q8WVY7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBLCP1Q8WVY7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms