Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCFD1Q8WVM8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms