Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAVCR2Q8TDQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms