Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4L1Q8NHW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms