Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC44A5Q8NCS7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A5Q8NCS7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC44A5Q8NCS7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms