Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD1Q8NB12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMYD1Q8NB12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms