Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC29Q8NA56 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC29Q8NA56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms