Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms