Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC71Q8N4P6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC71Q8N4P6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms