Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms