Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN12Q8IYM2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.4 ms