Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2Q8IXS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms